高级认证单项标准中，对从事加工贸易和保税业务的企业的要求如下：对与加工贸易或保税货物有关的进口、存储、转让、转移、销售、加工、使用、损耗和出口等情况的账簿、报表以及其他有关单证的准确性、一致性进行内部复核，并保管相关单证资料。
在通用标准的进出口单证标准中已经对进出口单证的复核做出了要求，对于加工贸易企业来说，则要对基本的加工贸易业务进行复核，包括手册/账册备案，内销，深加工结转，委托加工，核销等业务。以手册/账册备案和深加工结转业务为例说明加工贸易业务的复核流程。
手册/账册备案要对品名、品牌型号、规格、材质、成份、用途、价格、图片、单损耗，单重，价格进行复核。相关流程如下：
深加工结转业务要注重结转双方的资料数据统一，实际送货数量和结转数量一致。相关流程如下：
次回再对内销，委托加工，核销的复核流程进行详细说明。

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