2014年，海口海关全面推广通关作业无纸化改革、深化区域通关改革、启动关检合作“三个一”改革，力促贸易便利化；深化行政审批制度改革，推进简政放权，为我省进出口企业提供更加优质高效的服务。 其中，通关作业无纸化改革是海关总署改进海关监管与服务、促进外贸稳定增长的一项重要改革措施。海口海关在前期试点取得明显成效的基础上，于2014年5月30日起在全省所有通关现场全面推广通关作业无纸化改革。截至12月31日，共有538家企业已使用无纸化模式进行进出口申报，其中年进出口报关单量超过10票（含10票）的239家企业中，有222家已采用无纸化通关，占比92.9%。无纸化改革极大缩减了企业的时间、人力、财力等通关成本，有效提高了通关效率。无纸化进、出口报关单的平均通关时间分别比有纸报关单缩短62.38%、33.36%。
全面深化区域通关改革是海关适应全球经济一体化进程和国内区域性经济圈快速发展，促进对外经济贸易和现代国际物流发展的一种新的通关模式。海口海关积极拓展“属地申报、口岸验放”通关模式，方便我省企业在省内办理进出口货物在省外异地的报关手续，实现进出口货物的“一次申报、一次查验、一次放行”，有效降低企业跨区域通关成本和物流成本。同时，鼓励更多本省高资信企业申请并使用“属地申报、属地放行”通关模式，使企业享受更加高效的通关体验。全年关区共有8家企业应用“属地申报、口岸验放”模式进出口货值37.75亿元人民币。
关检合作“三个一”是海关和检验检疫部门创新口岸通关模式、推动通关便利化的一项重大改革创举，企业报关和报检两个环节一次录入数据合计减少77项，申报时间缩减30%，查验时间及相关费用节省50%。此项改革于2014年8月启动，11月13日海南省人民政府举行新闻发布会宣布正式推行至海南省所有的隶属海关和检验检疫分支机构、所有通关现场、所有依法需要报关报检的货物和物品。截至12月31日，共有27家企业开通运行“三个一”申报客户端，企业开展“一次申报”30批次，关检部门累计向海南电子口岸查验放行平台发送查验指令1109条、放行指令9199条。
同时，海口海关先后取消报关员资格核准、进境货物直接退运审批、企业分类管理等6类27项行政审批事项；简化审批流程，将“来往港澳小型船舶登记备案”等3项审批事项的审批时限提速50%，“出口监管仓库、保税仓库设立审批”等2项审批事项缩减1/3；高级认证企业评定时间由原来的180天减少至90天。海关行政审批事项平均办理时限由25.6天压缩至13天，提速49.2%。海关77％的业务办理事项和审批事项可实现“集中受理、统一办理、统一批复”。

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