海南博鳌是亚洲论坛年会的永久所在地。海口海关是亚洲论坛年会的协办单位，负责监管进出境人员、货物、物品，并提供通关便利。为展示中国和海南良好的世界形象，自2001博鳌亚洲论坛成立以来，该关谨记“国门”意识，积极发挥把关服务作用，服务论坛历届年会顺利召开。 提高思想认识，严密组织。从国家、海南的大局出发，增强政治敏感性和责任意识，在把好关的前提下，做到通关更加便捷，服务更加热情。成立“年会海关通关工作领导小组”，下设“年会专用通道工作小组”，并以海口美兰机场办、三亚凤凰机场办为窗口单位办理相关业务。对参会代表及新闻媒体人员的通关措施、年会物品和设备通关措施、专用通道设置、后勤保障等各项工作进行明确，细化操作办法，规范操作流程。
加强沟通，强化协调。在海南省口岸办召开的专门服务保障准备会上，从专业角度提出简化进出境航班联检手续的建议和意见；加强与省外事办的现场沟通合作，提前与省外事办协调新闻媒体人员携带进境摄影器材的通关监管问题；及时协调国际机场管理方解决海关监管车辆通行控制区、改善旅检场所硬件环境。
简化手续确保通畅，分类监管快速验放。在旅检现场和报关大厅设置专用通道及柜台，由熟悉外语的关员引导办理通关，实行提前报关或24小时预约通关，确保人员、货物、物品及时顺利快速通关。
2007年4月的博鳌亚洲论坛年会，该关采取免予监管、免验、方便礼遇等便利措施，快速验放前来参加会议的外国国家元首、政府首脑、部长及其他国内外知名人士138人次，会议用品878公斤，新闻媒体记者专用器材5批次。

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