上海危险品进口清关公司代理手续操作一般包括以下几个步骤：
1. 提供相关资料：进口合同、发票、装箱单、提单、危险品申报表、危险品包装证书、危险品运输标志等。
2. 报关公司进行资料审核，核对清关所需的手续和文件。
3. 缴纳相关费用：包括报关代理费、清关费、商检费、海关税费等。
4. 进行危险品检验：根据货物的种类和危险等级，需要进行不同程度的检验。
5. 办理危险品进口许可证：根据货物的种类和危险等级，需要办理相应的进口许可证。
6. 办理海关手续：包括海关查验、放行等手续。
费用方面，具体费用会根据货物的种类、数量、价值、危险等级等因素而有所不同，一般来说，报关代理费用在货物总价值的1%~3%之间，清关费用和其他费用也会根据具体情况而有所不同。

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