2008年11月12日，国务院正式批准设立重庆两路寸滩保税港区。该保税港区一期规划建设面积为2.67平方公里，其中水港功能区一期围网面积为1.77平方公里，包括了面积为0.4平方公里的出口加工区；空港功能区一期围网面积为0.9平方公里。2009年6月2日，重庆两路寸滩保税港区正式开工，通过11个月的建设，已基本完成保税港区(一期)各项监管、查验和配套设施的建设任务，总投资33.08亿元。
根据重庆市政府和重庆海关提出的正式验收申请，5月11日，由海关总署牵头，国土资源部、发展改革委、财政部等11部委组成的国务院联合验收组对重庆两路寸滩保税港区（一期）进行了正式验收。联合验收组在听取保税港区建设情况和预验收情况汇报，对保税港区水、空港功能区基础设施、隔离设施、卡口和通道设施、监管设施、相关配套设施实地现场验收的基础上，进行了详尽细致的评审。经评审，联合验收组认定重庆两路寸滩保税港区（一期）基础和监管设施基本符合《海关特殊监管区域基础和监管设施验收标准》的规定和要求，同意验收重庆两路寸滩保税港区（一期）2.67平方公里区域的基础和监管设施。联合验收组还向重庆保税港区开发管理有限公司颁发了《重庆两路寸滩保税港区验收合格证书》。
重庆两路寸滩保税港区是我国第11个保税港区，与其他保税港区相比，它具有三大特点：内陆型保税港区——是全国第一个设在内陆地区的保税港区，距离上海2300多公里；双功能型保税港区——是全国第一个“水港＋空港”的双功能保税港区；多围网型保税港区——是在已有土地规划和产业布局基础上，重新规划的保税港区，最终形成“一区双核三围网”的格局。
重庆保税港区的三大特点，也给海关监管带来了“远离出境口岸，能否及时签发退税联？一区双核三围网，如何实现在有效监管下的便捷高效？长江内支线运输，如何保障在途监管”这三大难题。为此，在海关总署和上海海关等沿海、沿江海关的大力支持、协助下，重庆海关举全关之力，由关长亲自牵头，调集业务、技术骨干组成攻关小组，认真调研、科学配置，通过以下措施，有效解决相关难题：一是报请海关总署批准采取“预结关＋转关”的监管模式，实现货物入区即签发退税联；二是以数据比对实现区内物流监控，以信息围网实现跨区严密监管，在确保有效监管的同时，实现了区内货物自由流转；三是以科技手段实现在途有效监管，通过gps+电子关锁，实现对集装箱/货的实时监控，解决了中途换载换装监管问题，为保税港区顺利通过国家正式验收和下一步封关运作提供了保障。
作为目前国内层次最高、政策最优惠、功能最齐全，通关最便捷的海关特殊监管区域，重庆两路寸滩保税港区下一步的正式运作将为重庆承接国际国内产业转移、打造内陆开放高地搭建起最大最优的政策平台，将为重庆经济社会大发展带来积聚物流、辐射西部，入区退税、降低成本，加速通关、高效运作，吸引投资、政策最优等四大利好。目前，已有69家境内外企业与重庆两路寸滩保税港区签订框架合作协议，有35家企业拟办理注册登记手续。下一步，随着重庆西永综合保税区的加速建设，不久的明天，重庆两路寸滩保税港区和重庆西永综合保税区将实现保税物流和保税加工的相互配套、相互促进，成为重庆开放型经济大发展的强劲“双引擎”！

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